സെന്റ് മേരീസ് ചർച്ച് വളരെ പുരാതന ചരിത്ര പശ്ചാത്തലത്തിൽ സമ്പന്നമാക്കിയിട്ടുണ്ട്. നൂറ്റാണ്ടുകളായി ഒരു പാരമ്പര്യമുണ്ട്. ഈ പുരാതന ചർച്ച് കുന്നഥന്തുനാട് പഞ്ചായത്തിലെ മൊറക്കല മേഖല എന്നറിയപ്പെടുന്ന സ്ഥലത്താണ് സ്ഥിതി ചെയ്യുന്നത്. കൊച്ചി സിറ്റി, കേരളത്തിലെ ട്രേഡിംഗ് നാഡി സെന്റർ, അലുവ ചിത്രപ്പുഴ റോഡിന് അഭിമുഖമായി, ത്രിപുനിത്തുരയിൽ നിന്ന് 12 കിലോ മീറ്റർ വടക്കായി പള്ളിയുടെ സ്ഥാനം നിർവചിക്കാൻ കഴിയും. റോഡുകളോ വാഹന സൗകര്യങ്ങളോ ഉണ്ടായിരുന്നില്ല; പടിഞ്ഞാറ് ഭാഗത്തുകൂടി ഒഴുകുന്ന ഒരു ചെറിയ നദിയായിരുന്നു ഈ പ്രദേശത്തേക്കുള്ള ഏക യാത്രാ മാർ. മലങ്കര വലിയ ഇടവക ഭരിച്ച വിശുദ്ധ പിതാക്കന്മാരിൽ ഭൂരിപക്ഷം ഈ പള്ളിയെ വഴിയിൽ അനുയോജ്യമായ വിശ്രമ സ്ഥലമായി കണ്ടെത്തി. പള്ളി തുടർന്നുന്ന ഈ പ്രദേശം പല്ലിക്കര എന്നാണ് അറിയപ്പെട്ടിരുന്നത്. സർവേ രേഖകൾ സ്ഥാപിക്കപ്പെടുമ്പോൾ, ഈ പ്രദേശം മൊറക്കല ഭൂമിയിൽ ഉൾപ്പെടുത്തിയിട്ടുണ്ടെന്ന് ചർച്ച് മൊറക്കല ചർച്ച് എന്നും സൂചിപ്പിച്ചു. അഞ്ചാം തർക്കമില്ലാത്ത ചരിത്ര യാഥാർത്ഥ്യമുണ്ട്, മലങ്കര ഓർത്തഡോക്സിലെ എല്ലാ സിറിയൻ സഭകളും മാർത്തോമ ദി അപ്പോസ്തലൻ സ്ഥാപിച്ച 7 പള്ളികളിൽ നിന്ന് രൂപപ്പെടുന്നു. ഈ സഭയുടെ ചരിത്രം, ഇന്ത്യയിലെ ക്രിസ്തുമതത്തിന്റെ ഉത്ഭവം, അതിന്റെ വളർച്ചയും വികാസവും അണിനിരക്കുന്നതായി തോന്നുന്നു.
മലങ്കര ഓർത്തഡോക്സിലെ യാക്കോബീറ്റ് ക്രിസ്ത്യാനികൾ പറയുന്നതനുസരിച്ച് പത്താം നൂറ്റാണ്ട് പ്രത്യേകിച്ചും നമ്മുടെ ഇടവകയിൽ വളരെ പ്രധാനപ്പെട്ട ഒരു സ്പാണ്. മിഴിവ്, ദർശനാത്മകങ്ങൾ എന്നിവരുടെ കീഴിൽ വനശീകരണം വളരെ അഭിവൃദ്ധി പ്രാപിച്ചപ്പോൾ അത് ഒരു യുഗമായിരുന്നു. ഒൻപതാം നൂറ്റാണ്ടിന്റെ അവസാനം വരെ, ഈ സ്ഥലങ്ങളിൽ താമസിക്കുന്ന ക്രിസ്ത്യാനികൾ അവരുടെ ആത്മീയ ആവശ്യങ്ങൾക്കായി പതിപ്പള്ളി പതിപ്പ് നൽകുന്നു. വ്യക്തമായും ഈ പ്രദേശങ്ങൾ എഡപ്പള്ളി രാജവംശത്തിന്റെ ഭരണത്തിൻ കീഴിലായിരുന്നു. രാജാക്കന്മാർ നിയന്ത്രിക്കുന്ന ഇന്റർ പ്രഭുക്കന്മാരുടെ സമാന്തരമായ ഭരണം ഉണ്ടായിരുന്നു. ഈ ഘട്ടത്തിൽ, ഈ സ്ഥലത്ത് ഒരു കുട്ടി വഞ്ചനാപരമായ ഒരു കുട്ടി ഉണ്ടായിരുന്നു, ഒരു ബോട്ടിൽ എടുത്ത കുട്ടിയെ ഒരു ബോട്ടിൽ അടക്കം ചെയ്യുന്നത്, നദിക്കരയിൽ വച്ച് മറ്റേതെങ്കിലും മാർഗവുമില്ല. ഈ പുരാതന കാലഘട്ടത്തിൽ എഡപ്പള്ളിയുടെ സെമിത്തേരി വളരെ ചെറുതായിരുന്നു, അതിനാൽ വിദൂര സ്ഥലങ്ങളിൽ നിന്ന് മര്യാപ്തനായ കാര്യത്തിൽ നാട്ടുകാർ സഹകരണമല്ല. അവർ എതിർക്കുകയും കുട്ടിയുടെ ശരീരം അടക്കം ചെയ്യാതെ മടങ്ങി. ഇവിടെ ഭരിച്ച ഇന്റർ പ്രഭുവർ അറക്കൽ കുടുംബമായിരുന്നു, കുട്ടിയുടെ മാതാപിതാക്കൾ അരക്കൽ കുഞ്ജമ്മയ്ക്ക് മുന്നിൽ അവരുടെ ദയനീയമായ സാഹചര്യത്തെ അറിയിച്ചു, കുട്ടിയെ സ്വന്തം ഭൂമിയിൽ അടക്കം ചെയ്യാൻ അനുമതി നൽകി. ശ്മശാനത്തിനുശേഷം ഒരു കുരിശ് സ്ഥാപിച്ചതിനുശേഷം, ആരാധനാ നടപടികൾക്കായി ഒരു സഭ സ്ഥാപിക്കാനുള്ള അനുമതി ആവശ്യപ്പെട്ട് പുരുഷന്മാർ അവളോട് അഭ്യർത്ഥിച്ചു. മിക്കവാറും സന്തോഷത്തോടെയുള്ള കുഞ്ജമ്മ ആവശ്യമായ ഭൂമിയെ (നികുതി ഇളവ്) അനുവദിക്കുകയും സഭ നിർമ്മിക്കാൻ ആവശ്യമായ പിന്തുണ വിപുലീകരിക്കുകയും ചെയ്തു. അങ്ങനെ പരസ്യ 905, ഫെബ്രുവരി 2-ാം ദിവസം പള്ളിക്കര സഭ സ്ഥാപിക്കപ്പെട്ടു. ക്രിസ്തുവിന്റെ ജറുസലേം ക്ഷേത്ര പ്രവേശനം ഒരേ ദിവസം തന്നെ ചരിത്രപരമായ പശ്ചാത്തലങ്ങൾക്ക് അനുസൃതമായിരുന്നു. വിശുദ്ധ മറിയയുടെ പേരിലാണ് പള്ളി സ്ഥാപിതമായത്.